缺乏人文沟通。互联网人为拉长了人们之间的距离，给人们直接交流感情制造了障碍。缺乏员工间的情感交流，讲师和员工之间缺乏情感交流，情绪交流的效果可能会大打折扣。实际操作功能薄弱，要真正掌握知识、技术，仅通过企业培训系统讲解是不够的，必须亲自参与实践，在实际操作中加以应用。
一、教学内容传递的局限性。
常规培训是由教师完全控制的学习环境进行的，需要随时进行调整和改变，影响教学的因素有很多，比如教师的努力和个人能力、技能、教育环境的适应性以及提供的课件等。但是，在企业培训系统中，由于与受训人员的网络隔离，这样的变化是不可能的，从而产生了关键的内容阻隔。

二、学习内容的局限性。
就学习内容而言，国内缺乏高质量、多媒体互动的企业培训系统课件和平台，不同的界面、重复登记、软件不规范，以及许多网络课程格式不一。如此不但不易管理，而且消耗很大，结果在公司内部建立一个好的沟通体系非常困难，信息传递极不畅通。
整体而言，通过系统对所有员工数据的统计分析，制作用户画像，帮助企业规范福利运营体系，有助于增强团队凝聚力，增强员工的存在感、参与感、认同感和成就感，使企业团队更具有共同的价值观，而从伟龙设计网站如何定位网校系统搭建的功能需求来看，企业网上培训系统的发展相对于那一小点局限性而言，还是有很大的优势。